부가가치세 확정신고와 마찬가지로 예정신고시에도 기본적으로 매출세액에서 매입세액을 차감하여 부가가치 납부세액을 구한다.
확정신고시와 다르게 적용되는 매입세액 공제 등 예정신고시 주의해야 할 내용은 다음과 같다.

의제매입세액공제

부가가치세 납부세액은 매출세액에서 사업자가 물품 등을 구입할 때 부담한 부가가치세를 공제하여 계산하지만, 예외적으로 부가가치세가 면제되는 농산물, 축산물, 수산물, 임산물 등의 원재료를 구입하여 이를 제조ㆍ가공하여 과세재화 또는 과세용역을 공급하는 경우에는 그 구입가액을 일정율에 해당하는 금액을 공제받을 수 있도록 하고 있는데 이를 의제매입세액공제라 한다.

의제매입세액공제액 = 면세로 구입한 농산물 등의 가액 X 2/102 (음식점은 3/103)

의제매입세액공제를 적용받기 위해서는 의제매입세액공제신고서와 함께 매입처별계산서합계표 등 관련증빙서류를 제출하여야 한다. 단, 2005년도부터는 농어민으로부터 직접 면세농산물 등을 공급받은 경우에는 의제매입세액공제신고서만 제출하도록 세법이 개정되었다.

조기환급

본래 부가가치세의 환급절차는 확정신고기한 경과 후 30일 이내에 환급한다.
과세기간 단위로 환급하므로 예정신고기간의 환급세액은 환급되지 아니하고 확정신고 시 납부할 세액에서 차감한다. 때문에 과세기간 중에 사업자가 부담한 매입세액은 과세기간이 경과한 후에나 돌려받기 때문에 사업자에게 자금부담이 될 수 있다.
이에 부가가치세는 조기환급제도를 두고 있는데, 환급세액이 발생하는 모든 경우에 조기환급이 되는 것은 아니며 다음 두 경우에만 가능하다.

▶ 영세율 적용대상인 때 ▶ 사업설비를 신설ㆍ취득ㆍ확장ㆍ증축하는 때

조기환급을 받고자 하는 사업자가 예정신고서를 제출하는 경우에는 환급에 관하여 신고한 것으로 보고, 위의 조기환급대상에 해당하는 사업자는 2007년 예정신고기한으로부터 15일 이내에 조기환급을 받을 수 있다. 단, 사업설비를 신설ㆍ취득ㆍ확장ㆍ증축하는 사업자는 <건물 등 감가상각자산 취득명세서> 를 제출하여야 한다.

영세율 신고 시 첨부서류 확인

영세율 신고시 과세표준을 신고하지 않거나 신고하여야 할 금액에 미달하게 신고한 경우에는 신고불성실가산세가 부과된다.
영세율 첨부서류를 제출하지 않은 경우에도 무신고로 간주되므로 성실하게 신고하고도 가산세를 무는 일이 발생하지 않게 첨부서류제출에 유념해야 한다.
법정신고기한 경과 후 6월 이내에 수정신고하는 경우 신고불성실가산세가 50% 경감되는데, 영세율 첨부서류 미제출로 인한 신고불성실 가산세는 50% 감면도 적용되지 않으므로 더욱 유념해야겠다.

재고매입세액 공제

간이과세자가 일반과세자로 전환된 경우에는 전환일 현재 재고품과 감가상각자산에 대하여 재고매입세액을 추가로 공제한다.

재고품과 감가상각자산에 대해서는 당초 간이과세자로서 매입세액공제를 받았으나, 그 금액이 일반과세자에 비하여 과소공제된다. 이에 재고매입세액공제를 두어 일반과세자였다면 공제받을 세액과 당초 공제받은 세액의 차이를 추가로 공제하는 것이다.
재고매입세액의 계산대상 자산은 과세유형 전환일 현재 보유하고 있는 재고품과 감가상각대상 자산이다.

재고품은 상품, 제품, 재료를 말하며, 비영업용 소형승용차와 같이 매입세액공제대상이 아닌 것은 계산대상에서 제외된다.
재고매입세액은 일반과세자로 승인을 얻은 날이 속하는 예정신고기간 또는 과세기간에서 공제하며, 그 금액이 매출세액보다 큰 경우에는 환급도 가능하다.

대손세액공제는 확정신고시에만

사업자가 외상매출금 등을 회수하지 못한 경우 동 외상매출금에 대한 매입세액을 공제하여 주는 대손세액공제는 확정신고 시에만 받을 수 있다.
예정신고시 대손세액공제를 적용하여 부가가치세를 신고납부하는 경우, 신고불성실가산세와 납부불성실가산세가 부과되므로 차감하여 신고하지 않도록 주의하여야 한다.

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